战双帕弥什中的研究所是活动商店的别称，主要分布在不同版本的活动中，例如异合生物研究所和42号研究所。这些研究所通常位于活动界面内，玩家通过完成特定关卡获取代币后，可兑换限定奖励，如意识、武器素材、收藏品等。研究所的入口和功能随版本更新而变化，但核心逻辑是通过代币兑换资源。
异合生物研究所是2020年11月版本的活动商店，需通过活动界面进入。玩家在异合渊薮和衍化断章关卡中获取代币异合生物样本，用于兑换双极光晶（抽涂装道具）、中式墙面装饰等限时奖励。该研究所的入口设计较为隐蔽，需点击活动主界面的二级菜单才能触发。
2022年4月更新的空晓界限版本中，活动商店更名为42号研究所，兑换内容新增六星意识布恩和跃升素材。玩家需根据资源优先级选择兑换：新意识＞跃升素材＞低阶突破材料，避免浪费代币。研究所的入口同样位于活动界面，但UI设计更直观，代币通过空晓防线关卡获取。
研究所的核心机制是代币-奖励兑换，但不同版本的代币名称、获取方式和奖励池均不同。异合生物样本与空晓代币不可通用，且兑换限时性较强。部分版本的研究所会加入剧情元素，如42号研究所与主线剧情空晓防线联动，增强叙事沉浸感。
